由于體外培養的細胞自身沒有抵抗污染的能力，而在培養基中加抗生素的抗污染能力也是有限的，一般在細胞受到污染早期或污染較輕時，能及時處理并除去污染物，部分細胞還有可能得到挽救。

通常情況下，會有哪些微生物會污染培養的細胞？

一、霉菌污染

污染的多是曲霉菌，白色念珠菌，酵母菌，黑霉菌，孢子菌等。霉菌污染后多數在培養液中形成淡黃色或是白色的漂浮物，一般肉眼可見，較易被發現，短期內培養液多不變混濁。
倒置顯微鏡下可以看見細胞之間有縱橫交錯穿行的絲狀，樹枝狀或管狀菌絲，并漂浮在培養液中。很多菌絲在高倍鏡下可以看見鏈狀排列的菌株。念珠菌及酵母菌菌株呈卵圓形，散在細胞上及細胞周邊生長。

二、酵母菌污染

酵母到處存在，并能在合適的環境中快速生長。酵母污染很容易觀察到，培養物變渾濁，尤其在后期。一般PH值變化很小，嚴重時，PH值升高。顯微鏡下呈卵圓形或球形顆粒，有些會長出較小顆粒。

三、耐藥細菌污染

細菌污染較常見的有大腸桿菌，白色葡萄球菌，假單孢菌等。加用抗菌素的培養液可預防和排除個別一般少量細菌的污染。一旦發生細菌污染很容易發現，多數情況下培養液短時間內變黃，表明有大量酸性物質產生，出現明顯渾濁現象；有時靜置的培養液起初不混，但稍加震蕩，就有許多混濁物漂起。

倒置顯微鏡下觀察，有時在細胞表面及周圍有大量細菌存在，細胞停止生長并有中毒表現，必要時可取少量培養液涂片染色檢查以明確細菌種類。

四、支原體污染

支原體是一種大小介于細菌和病毒之間(小直徑0.2um)并獨立生活的微生物．約有1%可通過濾菌器。支原體無細胞壁形態呈高度多形性，可為圓形、絲狀或梨形。

支原體形態多變，在光鏡下不易看清內部結構。多數支原體適合于偏堿條件下生存(PH7.6-8.0)，對酸耐受性差。對熱比較敏感，對一般抗生素不敏感。

支原體污染細胞后，培養液可不發生混濁。多數情況下細胞病理變化輕微或不顯著，細微變化也可由于傳代、換液而緩解，因此易被忽視。但個別嚴重者，可致細胞增殖緩慢，甚至從培養器皿脫落。

為確定有無支原體污染可做如下檢測：熒光染色法支原體檢測、PCR法支原體檢測、qPCR支原體檢測、電鏡檢查。

五、黑膠蟲污染

黑膠蟲污染細胞后，細胞生長會變緩慢，與細胞共生，競爭營養，培養液可不發生混濁。細胞間隙內出現小黑點，會不斷變多，且對各類抗生素無效，顯微鏡下可以看到小黑點原地跳動，細胞狀態變化會因為傳代、換液而有所改善，因此易被忽視。但個別嚴重者，可致細胞空泡化，出現很多細胞碎片等。

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